Ayuda con archivo M2TS

Hola a tod@s, tengo 3 archivos de video (mts) descargados de internet y lo que quiero hacer es unirlos con mkvtoolnix para luego pasarlo a una unidad de disco duro externa y finalmente poder reproducirla en mi led. El problema es que la introducción del video está grabada en 48khz, 16 bits y las otras dos partes están en 96khz, 24 bits y al tratar de unirlas con mkvtoolnix, me dá error por estar en diferentes tasas de muestreo. Habrá alguien que pueda darme una ayuda con esto, pues traté de convertirlo con audacity, pero no hubo resultado.
Traté de "subir" la intro pero no pude por aquí, si alguien quiere darme una ayuda con este problemilla, dejo mi email josepinillos69@gmail.com
La intro solo dura 35 segundos. Muchas gracias... saludos

Prueba a pasarlas a la misma resolución con Handbrake y luego ya las unes con el programa que suelas usar para eso.

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Utiliza un convertidor de archivos como el Any Mp4 Video Converter Ultimate, con él puedes convertir los m2ts a Mp4 o MKV (acabo de comprobarlo), después ya puedes unirlos como siempre.